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要删除苹果短信备份，可以按照以下步骤操作。
1、打开设置，进入最上方的Apple ID选项。
2、点击iCloud选项，查看短信是否已经同步到云端，如果已备份至云端，则需要在电脑上登录iCloud官网。
3、登录后，找到并打开信息（短信）选项，在此界面上，可以看到所有的短信记录，选择要删除的短信备份，然后按照提示进行删除操作。
如果使用iTunes备份手机数据的话，也可以按照以下步骤删除短信备份：
1、连接iPhone到电脑，然后打开iTunes。
2、在设备界面选择信息选项，点击进入后可以看到备份中的短信。
3、选择想要删除的备份短信，点击删除或者清空全部内容来完成删除操作。
这些操作会永久删除备份中的短信数据，请在操作前确认所选无误并谨慎操作，同时请注意数据恢复的风险，如果不确定如何操作或担心误操作导致数据丢失，建议咨询专业人士或苹果官方客服协助处理。